Malcolm Turner se retrouve à nouveau sous couverture, cette fois-ci pour protéger les enfants d'un agent du FBI. Il se fait passer pour Nana, la nounou embauchée pour s'occuper des enfants pendant que leur mère travaille. Alors qu'il essaie de mener à bien sa mission, Malcolm doit jongler entre les responsabilités de la vie de famille et son enquête secrète. Le film est une comédie pleine de situations loufoques et de gags visuels. Malcolm, sous les traits de Nana, doit faire face à des situations comiques tandis qu'il tente de garder son identité secrète tout en prenant soin des enfants turbulents. Les scènes hilarantes se succèdent alors que Malcolm essaie de rester un pas en avant de ceux qui pourraient découvrir sa véritable identité. En parallèle, le film explore également les thèmes de la famille et de l'importance des liens familiaux. Malcolm, en se rapprochant des enfants et de leur mère, apprend des leçons sur la parentalité et découvre l'importance de la confiance et de l'amour au sein d'une famille.